Os Programas de Residência constituem modalidade de ensino de pós-graduação, destinada a médicos e multiprofissionais, sob a forma de cursos de especialização, caracterizada por treinamento em serviço, sob orientação de profissionais de elevada qualificação profissional. Têm objetivos fundamentais e indivisíveis: aperfeiçoamento progressivo do padrão profissional e científico médico e multiprofissional. Melhoria de assistência aos pacientes, familiares e comunidade nas áreas profissionalizantes, sendo necessário para tal, que o residente cumpra integralmente as atividades práticas e teóricas constantes nos mesmos.
Os Programas de Aprimoramento Profissional, objetivam incrementar o desenvolvimento e a formação de profissionais nas áreas médicas do Hcor. Visa também promover a qualificação e a complementação da formação científica de profissionais nas diversas áreas médicas de atividade no Hcor, de acordo com os regimentos internos das áreas envolvidas e da Comissão de Residência Médica (COREME). Além disso, propõe disseminar, junto a sociedade, os conhecimentos e a tecnologia disponibilizados pelo Hcor, de acordo com sua visão e missão.